Вопросы с тэгом [snakemake]

голоса
5
ответов
4
просмотр
490
режим Emacs для snakemake?
Задан 15/06/2013 в 20:08
пользователем user2489449
Задан 11/08/2015 в 10:03
пользователем Marcel M
Задан 24/08/2015 в 10:52
пользователем rioualen
Задан 31/08/2015 в 14:40
пользователем rioualen
голоса
2
ответов
2
просмотр
537
Всегда выполняйте правила в Snakefile (snakemake)
Задан 08/04/2016 в 10:05
пользователем Chris
голоса
2
ответов
2
просмотр
202
программирование трубопровода параллельно
Задан 17/06/2016 в 18:21
пользователем VickiT05
Задан 21/06/2016 в 20:27
пользователем VickiT05
голоса
0
ответов
1
просмотр
776
Re-записи с защитой от записи файла
Задан 29/06/2016 в 13:04
пользователем VickiT05
Задан 08/07/2016 в 07:49
пользователем The Unfun Cat
Задан 26/10/2016 в 11:12
пользователем bli
голоса
3
ответов
2
просмотр
466
Как сделать частичное расширение в Snakemake?
Задан 03/11/2016 в 09:37
пользователем bli
Задан 09/11/2016 в 15:19
пользователем bli
Задан 09/11/2016 в 15:53
пользователем user3213137
голоса
3
ответов
2
просмотр
1k
Snakemake: Имя правила вместо целевого файла
Задан 10/11/2016 в 23:08
пользователем blaurent
голоса
1
ответов
1
просмотр
115
Как выразить явные и неявные правила в Snakemake?
Задан 13/11/2016 в 10:13
пользователем Stephan
Задан 15/11/2016 в 05:49
пользователем Andreas
Задан 18/11/2016 в 00:27
пользователем olala
Задан 18/11/2016 в 21:04
пользователем olala
Задан 21/11/2016 в 02:28
пользователем Andreas
Задан 21/11/2016 в 21:36
пользователем Harold
Задан 22/11/2016 в 15:39
пользователем Andreas
голоса
0
ответов
1
просмотр
213
Snakemake кластера конфигурации в сочетании с DRMMA
Задан 23/11/2016 в 16:43
пользователем fitziano
голоса
2
ответов
1
просмотр
346
Snakemake: зависимости, которые не вход
Задан 25/11/2016 в 10:27
пользователем blaurent
Задан 02/12/2016 в 16:09
пользователем bli
Задан 02/12/2016 в 21:40
пользователем olala
голоса
3
ответов
2
просмотр
182
Текущий властвуй в Snakemake
Задан 05/12/2016 в 13:59
пользователем glihm
голоса
1
ответов
2
просмотр
293
Snakemake: удаление выходного файла
Задан 06/12/2016 в 13:30
пользователем blaurent
голоса
3
ответов
2
просмотр
363
Повторное правило, в Snakemake
Задан 06/12/2016 в 16:17
пользователем glihm
голоса
1
ответов
1
просмотр
49
Установка snakemake без интернета
Задан 11/12/2016 в 18:36
пользователем MichelleN
голоса
0
ответов
1
просмотр
84
Snakemake + tmux
Задан 11/12/2016 в 19:26
пользователем domino55
голоса
-1
ответов
1
просмотр
150
вопросы LSF snakemake
Задан 13/12/2016 в 12:38
пользователем naamako
Задан 14/12/2016 в 05:57
пользователем kdmurrray91
Задан 16/12/2016 в 13:31
пользователем bli
Задан 20/12/2016 в 19:57
пользователем Jon
голоса
1
ответов
0
просмотр
56
Определение функций для Geany «FILETYPE»
Задан 04/01/2017 в 13:59
пользователем Gil Hornung
Задан 04/01/2017 в 14:07
пользователем rioualen
Задан 12/01/2017 в 17:49
пользователем vtrubets
голоса
1
ответов
1
просмотр
99
Глобально библиотеки нагрузки R в Snakemake
Задан 13/01/2017 в 17:01
пользователем Zuup
голоса
0
ответов
1
просмотр
428
Как получить рабочий путь к каталогу?
Задан 16/01/2017 в 11:52
пользователем rioualen
Задан 17/01/2017 в 13:55
пользователем Robyc
голоса
1
ответов
3
просмотр
453
использовать несколько параметров в snakemake
Задан 20/01/2017 в 16:16
пользователем Kam Sen
Задан 27/01/2017 в 16:40
пользователем Zuup
Задан 15/02/2017 в 16:08
пользователем bli
Задан 21/02/2017 в 10:44
пользователем Zuup
голоса
0
ответов
3
просмотр
246
Snakemake: MissingInputException в snakemake трубопровода
Задан 06/03/2017 в 15:42
пользователем Mesmer
Задан 08/03/2017 в 15:27
пользователем Veera
Задан 16/03/2017 в 14:21
пользователем bli
Задан 16/03/2017 в 15:36
пользователем lvw
Задан 17/03/2017 в 07:55
пользователем Kolja
Задан 22/03/2017 в 05:56
пользователем RNA
Задан 24/03/2017 в 18:18
пользователем Veera




Задан 28/03/2017 в 15:14
пользователем lvw
Задан 30/03/2017 в 16:51
пользователем crazyhottommy
Задан 10/04/2017 в 16:01
пользователем Zen
Задан 12/04/2017 в 15:00
пользователем msakya
голоса
1
ответов
1
просмотр
63
Snakemake: образцы с подпунктами, как поймать их?
Задан 07/05/2017 в 14:43
пользователем hetica
Задан 11/05/2017 в 11:22
пользователем tdido
голоса
1
ответов
2
просмотр
296
Snakemake ПГОС кластера Представление Issue
Задан 16/05/2017 в 20:56
пользователем x.Doan
Задан 23/05/2017 в 10:03
пользователем Anna Jeanine
Задан 25/05/2017 в 01:54
пользователем TBoyarski
Задан 25/05/2017 в 08:22
пользователем user3015703
голоса
2
ответов
1
просмотр
88
Использование pyenv в правиле snakemake
Задан 01/06/2017 в 19:55
пользователем rbrisk
Задан 08/06/2017 в 00:02
пользователем TBoyarski
голоса
2
ответов
1
просмотр
236
MissinOutputException в snakemake
Задан 09/06/2017 в 08:32
пользователем Jokhe
Задан 15/06/2017 в 07:23
пользователем user3015703
голоса
1
ответов
1
просмотр
116
Thread.py snakemake ошибка
Задан 18/06/2017 в 14:35
пользователем user3015703
Задан 22/06/2017 в 14:24
пользователем user3015703
голоса
2
ответов
2
просмотр
108
Как получить доступ к cluster_config Dict в правиле?
Задан 27/06/2017 в 16:52
пользователем Jon
Задан 27/06/2017 в 16:56
пользователем K.Lai
голоса
2
ответов
1
просмотр
467
динамический выход в snakemake
Задан 29/06/2017 в 01:16
пользователем ate50eggs
Задан 04/07/2017 в 14:04
пользователем Alexandre.S
голоса
1
ответов
1
просмотр
80
протоколирование команда Wrapper: Snakemake
Задан 12/07/2017 в 01:04
пользователем sebio
Задан 14/07/2017 в 21:26
пользователем Bruno Grande
Задан 21/07/2017 в 20:09
пользователем Vivek-Bh
Задан 25/07/2017 в 13:13
пользователем mau_who
голоса
1
ответов
1
просмотр
108
Понимание и преодоление AmbiguousRuleException в snakemake
Задан 26/07/2017 в 16:58
пользователем bli
Задан 28/07/2017 в 13:34
пользователем bli
голоса
0
ответов
1
просмотр
36
прикованные параметры SnakeMake
Задан 28/07/2017 в 21:18
пользователем tedtoal
Задан 01/08/2017 в 16:20
пользователем mau_who
Задан 03/08/2017 в 02:20
пользователем TBoyarski
голоса
-4
ответов
2
просмотр
64
Куда сообщать предложения по SnakeMake
Задан 03/08/2017 в 18:51
пользователем tedtoal
Задан 03/08/2017 в 20:34
пользователем tedtoal
голоса
1
ответов
2
просмотр
475
snakemake символы или расширить команду
Задан 04/08/2017 в 13:49
пользователем mau_who
голоса
0
ответов
0
просмотр
121
snakemake конфигурации доступа в выходной
Задан 04/08/2017 в 18:16
пользователем Matt
Задан 07/08/2017 в 18:44
пользователем tedtoal
голоса
1
ответов
1
просмотр
32
Как получить доступ snakemake имя сценария?
Задан 07/08/2017 в 22:33
пользователем tedtoal
Задан 08/08/2017 в 16:39
пользователем Zuup
Задан 08/08/2017 в 20:09
пользователем tedtoal
Задан 09/08/2017 в 10:37
пользователем mau_who
голоса
3
ответов
0
просмотр
89
Snakemake: динамический + нединамическая выход
Задан 09/08/2017 в 20:10
пользователем Sean Colby
Задан 10/08/2017 в 08:09
пользователем bli
Задан 10/08/2017 в 12:33
пользователем rioualen
Задан 10/08/2017 в 23:44
пользователем tedtoal
Задан 16/08/2017 в 13:56
пользователем tdido
Задан 17/08/2017 в 06:39
пользователем Jan Schreiber
Задан 17/08/2017 в 21:08
пользователем yevishere
Задан 18/08/2017 в 20:59
пользователем tedtoal
голоса
0
ответов
1
просмотр
31
выпуск кронштейн в команде snakemake кластера
Задан 18/08/2017 в 21:42
пользователем yevishere
голоса
0
ответов
0
просмотр
53
Рабочий процесс Разъединение
Задан 19/08/2017 в 04:58
пользователем domino55
голоса
0
ответов
0
просмотр
35
MissingOutputException с помощью Python 3 и ReportLab
Задан 21/08/2017 в 10:47
пользователем merella.stefania
Задан 21/08/2017 в 16:15
пользователем Alistair Miles




Задан 21/08/2017 в 20:42
пользователем yevishere
Задан 28/08/2017 в 09:01
пользователем khikho
голоса
1
ответов
1
просмотр
105
Использование argparse в Snakemake сценарии
Задан 30/08/2017 в 23:57
пользователем JeeYem
Задан 31/08/2017 в 20:44
пользователем tedtoal
голоса
0
ответов
1
просмотр
39
Любой анализ пути написанный в змеином
Задан 31/08/2017 в 22:54
пользователем user977828
Задан 05/09/2017 в 22:00
пользователем tedtoal
Задан 06/09/2017 в 03:57
пользователем mitoRibo
голоса
0
ответов
1
просмотр
119
Команда Snakemake сенсорный
Задан 06/09/2017 в 10:13
пользователем mau_who
Задан 08/09/2017 в 16:32
пользователем hardingnj
голоса
0
ответов
1
просмотр
37
Прокси-файл на snakemake код
Задан 11/09/2017 в 14:11
пользователем mau_who
голоса
1
ответов
1
просмотр
134
Несколько «Титулы» в Snakemake файле
Задан 13/09/2017 в 10:00
пользователем Michael Schubert
Задан 13/09/2017 в 13:06
пользователем Michael Schubert
Задан 19/09/2017 в 12:53
пользователем user4249654
голоса
0
ответов
1
просмотр
80
snakemake как кодировать пару анализов
Задан 19/09/2017 в 21:56
пользователем mau_who
Задан 25/09/2017 в 06:25
пользователем tedtoal
голоса
0
ответов
1
просмотр
117
правила Snakemake
Задан 25/09/2017 в 06:43
пользователем jk_kim
голоса
0
ответов
1
просмотр
86
snakemake управлять образец пара и indelrealigner
Задан 25/09/2017 в 20:18
пользователем mau_who
Задан 26/09/2017 в 12:51
пользователем mgalardini
Задан 26/09/2017 в 13:36
пользователем Rewati Tappu
голоса
0
ответов
1
просмотр
140
Входные подстановочные Ограничения Snakemake
Задан 01/10/2017 в 00:58
пользователем Mike Dacre
Задан 02/10/2017 в 15:45
пользователем hardingnj
Задан 04/10/2017 в 01:24
пользователем bwubb
голоса
2
ответов
2
просмотр
148
Обработка ошибок SIGPIPE в snakemake
Задан 04/10/2017 в 15:56
пользователем dariober
голоса
0
ответов
1
просмотр
57
Время задержки для snakemake
Задан 06/10/2017 в 12:00
пользователем mau_who
Задан 08/10/2017 в 17:12
пользователем sharchaea
Задан 08/10/2017 в 22:50
пользователем tedtoal
Задан 12/10/2017 в 16:25
пользователем David M
голоса
1
ответов
1
просмотр
46
Правильно доступ cluster_config «__default__» значения
Задан 13/10/2017 в 16:08
пользователем bwubb
голоса
1
ответов
1
просмотр
122
Значение эталонных переменных в snakemake
Задан 18/10/2017 в 15:03
пользователем bli
Задан 19/10/2017 в 07:17
пользователем Kim
Задан 20/10/2017 в 19:23
пользователем Sajber
Задан 20/10/2017 в 20:14
пользователем Colin
Задан 24/10/2017 в 10:32
пользователем Sajber
голоса
0
ответов
1
просмотр
60
Рекурсия / зацикливание правил в snakemake
Задан 26/10/2017 в 06:38
пользователем Cerikson
Задан 26/10/2017 в 07:43
пользователем A. Fust
Задан 27/10/2017 в 13:03
пользователем bwubb
Задан 03/11/2017 в 02:44
пользователем SlowLearner
голоса
0
ответов
0
просмотр
45
snakemake фильтрации динамических файлов
Задан 03/11/2017 в 10:23
пользователем Fenrir
Задан 03/11/2017 в 18:22
пользователем bli
Задан 07/11/2017 в 02:21
пользователем Cerikson
Задан 07/11/2017 в 15:03
пользователем ezhao15
Задан 09/11/2017 в 21:47
пользователем mau_who
Задан 10/11/2017 в 04:16
пользователем tedtoal
Задан 12/11/2017 в 12:44
пользователем pirovc
Задан 13/11/2017 в 15:15
пользователем Carlus
Задан 13/11/2017 в 16:32
пользователем Carlus
Задан 15/11/2017 в 20:12
пользователем JeeYem
Задан 15/11/2017 в 23:46
пользователем dugar
голоса
1
ответов
0
просмотр
23
Включение опции в snakefile
Задан 20/11/2017 в 17:52
пользователем tedtoal
Задан 20/11/2017 в 23:13
пользователем Barry Moore




Задан 21/11/2017 в 14:20
пользователем Kamil S Jaron
Задан 24/11/2017 в 09:57
пользователем rioualen
Задан 29/11/2017 в 14:50
пользователем l0o0
Задан 01/12/2017 в 19:49
пользователем JeeYem
голоса
0
ответов
0
просмотр
55
snakemake: не совместим с г 3.4.0 (создание среды)
Задан 04/12/2017 в 14:55
пользователем fiona
голоса
0
ответов
0
просмотр
103
как подстановочные знаки в правилах, Snakemake
Задан 04/12/2017 в 19:52
пользователем Yan W.
Задан 05/12/2017 в 04:14
пользователем Hirak Sarkar
голоса
1
ответов
0
просмотр
34
Слишком много файлов в `.snakemake` папке
Задан 12/12/2017 в 12:24
пользователем Jan Schreiber
голоса
0
ответов
0
просмотр
21
как найти правильный репозиторий
Задан 14/12/2017 в 01:56
пользователем Anlin Li
голоса
0
ответов
1
просмотр
65
Snakemake одной маски, а также расширить
Задан 18/12/2017 в 16:36
пользователем par
голоса
2
ответов
0
просмотр
32
Snakemake: вернуться и очистить темп () файлы
Задан 19/12/2017 в 14:29
пользователем Jonathan Manning
Задан 19/12/2017 в 19:33
пользователем Bharat
голоса
0
ответов
1
просмотр
51
snakemake различных сред за subworkflow
Задан 22/12/2017 в 09:32
пользователем Tjitske
Задан 28/12/2017 в 06:29
пользователем Daniel Standage
Задан 28/12/2017 в 14:15
пользователем rioualen
Задан 05/01/2018 в 08:37
пользователем Anlin Li
Задан 05/01/2018 в 11:05
пользователем rioualen
голоса
1
ответов
1
просмотр
92
Отсутствующие символы в S4 snakemake объекта в R
Задан 05/01/2018 в 17:08
пользователем Patrick Roelli
Задан 09/01/2018 в 12:18
пользователем Chris
Задан 09/01/2018 в 18:16
пользователем fakechek
голоса
0
ответов
1
просмотр
63
правило, не подобран snakemake
Задан 10/01/2018 в 15:29
пользователем yahan
Задан 11/01/2018 в 21:16
пользователем user1973192
Задан 15/01/2018 в 13:00
пользователем Julien Lagarde
Задан 19/01/2018 в 15:57
пользователем Uri Laserson
голоса
1
ответов
0
просмотр
49
лямбда-выражение на входных аргументов
Задан 21/01/2018 в 16:16
пользователем khikho
Задан 24/01/2018 в 04:18
пользователем Andreas
Задан 24/01/2018 в 14:03
пользователем tfenne
Задан 25/01/2018 в 09:55
пользователем yahan
голоса
1
ответов
0
просмотр
126
Snakemake: R скрипт не удается (почти) сразу
Задан 25/01/2018 в 10:17
пользователем fakechek
Задан 25/01/2018 в 13:03
пользователем bapors
Задан 25/01/2018 в 19:50
пользователем seandavi
Задан 28/01/2018 в 16:35
пользователем Lucas van Dijk
голоса
1
ответов
1
просмотр
55
Snakemake память ограничения
Задан 31/01/2018 в 12:33
пользователем bapors
Задан 01/02/2018 в 03:00
пользователем Mike Dacre
Задан 01/02/2018 в 17:07
пользователем anilbey
голоса
1
ответов
0
просмотр
19
Snakemake: многоуровневый JSON синтаксический
Задан 06/02/2018 в 09:24
пользователем Nicolas Rosewick
Задан 07/02/2018 в 17:30
пользователем user9328894
Задан 07/02/2018 в 19:02
пользователем Thomas Moody
Задан 08/02/2018 в 12:37
пользователем anilbey
голоса
1
ответов
1
просмотр
44
InputFunctionException с KeyError
Задан 09/02/2018 в 16:08
пользователем user3015703
Задан 09/02/2018 в 20:34
пользователем K.Lai
голоса
0
ответов
1
просмотр
24
Функция ввода snakemake странные результаты
Задан 09/02/2018 в 20:36
пользователем mau_who
голоса
1
ответов
1
просмотр
58
Snakemake: Ошибка с unexisting шаблона
Задан 12/02/2018 в 13:35
пользователем Nicolas Rosewick
Задан 14/02/2018 в 10:03
пользователем user9328894
голоса
0
ответов
1
просмотр
65
snakemake сгруппировать файлы по маске
Задан 14/02/2018 в 11:32
пользователем Nicolas Rosewick
голоса
1
ответов
0
просмотр
66
Иерархический динамический выход в snakemake
Задан 15/02/2018 в 12:08
пользователем kiero
голоса
0
ответов
1
просмотр
41
Snakemake не играет хорошо с Wget
Задан 16/02/2018 в 00:35
пользователем conchoecia
голоса
0
ответов
1
просмотр
33
Snakemake: как изменить вкладку буквального
Задан 20/02/2018 в 15:21
пользователем Nicolas Rosewick
голоса
0
ответов
1
просмотр
79
Вручную создать snakemake символы
Задан 21/02/2018 в 15:09
пользователем fakechek

Cookies help us deliver our services. By using our services, you agree to our use of cookies. Learn more